In 1999 werd Valkenheide onderdeel van de Leo Stichting Groep (LSG). Dit was een samenwerkingsverband tussen de residentiële jeugdzorginstellingen Nieuw Veldzicht (Almere), Commujon (Almelo), Bredervoort (De Glind) en Valkenheide. De vier onderdelen hielden een eigen directeur en opereerden relatief zelfstandig.
Het centraal bureau werd gevestigd in het leegstaande pand van Nieuw Veldzicht in Apeldoorn. Deze instelling was inmiddels naar nieuwbouw in Almere verhuisd.